BigWig, Wiggle (WIG) formatından dönüştürülerek oluşturulan bir genom tarayıcı parçasında yoğun, sürekli verilerin görüntülenmesi için bir dosya formatıdır. BigWig formatı UCSC Genome Bioinformatics web sitesinde açıklanmıştır ve Broad Institute dosya formatı kılavuzu ek bilgi sağlar.
BigWig formatı nedir?
BigWig formatı bir grafik olarak görüntülenecek yoğun, sürekli verilerin görüntülenmesi içindir BigWig dosyaları başlangıçta UCSC programı wigToBigWig kullanılarak WIG tipi dosyalardan oluşturulur. Alternatif olarak, UCSC programı bedGraphToBigWig kullanılarak bedGraph dosyalarından bigWig dosyaları oluşturulabilir.
bigWig dosyasını nasıl kullanırım?
Yeni oluşturulan bigWig dosyasını (myBigWig.bw) web'den erişilebilen bir http, https veya ftp konumuna. URL'yi özel iz giriş formuna yapıştırın veya tek bir iz satırı kullanarak özel bir iz oluşturun. Özel iz yönetimi sayfasındaki metin kutusuna özel iz satırını yapıştırın.
BigWig parçası nedir?
bigWig Parçaları, tüm genom boyunca sürekli sinyaller için izlerdir. ChIP-Seq sinyalleri, RNA-Seq sinyalleri vb. gibi çeşitli "ham" deney sonuçlarını görüntülemek için uygundurlar.
Bir bigWig dosyasını nasıl oluştururum?
Bigwig dosyaları oluşturmanın birden çok yolu vardır. Bu genellikle bir. bam dosyasını bir kıpırdatma izine (. peruk) ve ardından kıpırdatma izini ikili bir büyük peruka (.) dönüştürmek
