Bütün amino asitler α-helislerde bulunur, ancak glisin ve prolin, α-heliksi destabilize ettikleri için nadirdir. Glisin birçok sterik kısıtlamadan muaftır çünkü β karbondan yoksundur. … Proline ise çok katı.
Hangi amino asit alfa sarmallarında bulunmaz?
Prolin özel siklik yapıya sahip olduğundan (amino asit değil imino asittir) proteinlerin alfa sarmal yapısında bulunmaz. belirli genişlik ve belirli sayıda amino asit kalıntısı / dönüş. Bu nedenle prolin, alfa sarmal kırıcı olarak kabul edilir.
Glisin neden bir alfa sarmal kırıcıdır?
Prolin ve glisin bazen "sarmal kırıcılar" olarak bilinir çünkü α sarmal omurga yapısının düzenini bozarlar; ancak, her ikisinin de olağandışı biçimsel yetenekleri vardır ve genellikle sırayla bulunurlar.
Glisin alfa sarmalının neresinde?
Sarmal-dönüş-sarmal motifinde yüksek oranda korunmuş üç konum vardır. Bir alanin genellikle birinci α sarmalı içinde 5 konumunda bulunur; dönüşün ilk konumu olan konum 9'da bir glisin bulunur; ve valin veya izolösin genellikle ikinci α sarmalının 15. konumunda bulunur.
Glisin kalıntıları ağırlıklı olarak alfa sarmallarında mı bulunur?
Glisin, olası birçok ana zincir biçimiyle, helislerde de nadiren bulunur. Bir alfa sarmalında bir amino asidin ne kadar muhtemel olduğunu (sarmal eğilimleri olarak adlandırılır) bilerek, bir protein dizisinde sarmalların nerede meydana geldiğini tahmin etmek mümkündür.
