SDS, sırasıyla sülfat grupları ve alkil zincirleri yoluyla pozitif yüklü ve proteinlerin hidrofobik kalıntılarına güçlü bir şekilde bağlanır13 Buna göre, yapısal biyoloji ve protein katlama/açma çalışmaları alanında değerli bir deterjandır.
SDS bir proteine ne yapar?
SDS, amfipatik bir yüzey aktif maddedir. Protein zincirine hidrokarbon kuyruğuyla bağlanarak, normalde gömülü bölgeleri açığa çıkararak ve protein zincirini sürfaktan molekülleri ile kaplayarak proteinleri denatüre eder. SDS'nin kutup başı grubu, bu denaturantın kullanımına ek bir fayda sağlar.
SDS amino asitlere nasıl bağlanır?
SDS, protein (polipeptit) zincirleriyle güçlü bir şekilde etkileşime giren hidrofobik bir kuyruğa sahiptir. Bir proteine bağlanan SDS moleküllerinin sayısı, proteini oluşturan amino asitlerin sayısıyla orantılıdır Her SDS molekülü, proteinin sahip olabileceği herhangi bir yükün üstesinden gelen iki negatif yüke katkıda bulunur.
SDS proteinleri kaplar mı?
SDS ayrıca proteini, R-gruplarındaki içsel yükleri maskeleyen tek tip bir negatif yük ile kaplar. SDS, lineer proteinlere (yaklaşık 1.4g SDS/1g protein) oldukça düzgün bir şekilde bağlanır, bu da proteinin yükünün artık yaklaşık olarak moleküler ağırlığıyla orantılı olduğu anlamına gelir.
SDS proteine nasıl negatif yük verir?
SDS, uzun bir alifatik zincir ve bir sülfat grubu içeren bir deterjandır. Bu deterjan, güçlü negatif yüklü bir kompleks oluşturmak için denatüre proteinler ile etkileşime girer (SO42 − SDS grupları). Proteinler önce ısı ile denatüre edilir ve daha sonra SDS fazla miktarda eklenir.
