1.1 α-Helisler. α sarmalı, amino asitler yan zincirlerin merkezi sarmaldan işaret ettiği yerde sağ elli bir sarmal oluşturmak üzere "sarıldığında" oluşan protein ikincil yapısının ortak bir öğesidir (Şekil 3.1A, B).
Alfa sarmallarının oluşmasına ne sebep olur?
Alfa sarmalı, amino asit zincirinde bir çubuk şekli oluşturmasına neden olan sıkı bir sağ elle bükülme ile karakterize edilir. Bir amino grubundaki hidrojen ile amino asit üzerindeki karboksil grubundaki oksijen arasındaki hidrojen bağları bu yapıya neden olur.
Alfa sarmalları ve beta sayfaları nasıl oluşur?
Alfa sarmalı, polipeptit zincirleri bir spiral şeklinde büküldüğünde oluşur Bu, zincirdeki tüm amino asitlerin birbirleriyle hidrojen bağları oluşturmasını sağlar.… Beta kıvrımlı tabaka, yan yana uzanan polipeptit zincirleridir. Dalga benzeri görünümünden dolayı pileli levha olarak adlandırılır.
Hangi amino asitler sarmal oluşturur?
Farklı amino asit dizileri, α-sarmal yapı oluşturmak için farklı eğilimlere sahiptir. Metionin, alanin, lösin, glutamat ve yüksüz lisin (amino asit 1 harfli kodlarda "MALEK") özellikle yüksek sarmal oluşturma eğilimlerine sahipken, prolin ve glisin zayıf sarmal oluşturma eğilimleri.
Birincil yapıdan ikincil protein yapısı nasıl oluşur?
Bir proteinin birincil yapısı yalnızca amino asit dizisiyle tanımlanır ve bitişik amino asit kalıntıları arasındaki peptit bağlarıyla oluşturulur. İkincil yapı, polipeptit omurgası boyunca hidrojen bağından kaynaklanır, bu da alfa sarmallar ve beta kıvrımlı tabakalarla sonuçlanır.
