BLAST, Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) web sitesinde ve diğer birçok sitede çevrimiçi olarak kullanılabilen bir bilgisayar algoritmasıdır. BLAST, bir sorgu DNA dizisini bir dizi veritabanıyla hızla hizalayabilir ve karşılaştırabilir; bu, onu devam eden genomik araştırmalarda kritik bir araç haline getirir.
BLAST birincil veritabanı mı?
BLAST, biyoinformatik araştırmalarında en yaygın kullanılan yazılımdır. Ana işlevi, ilgilenilen bir diziyi, sorgu dizisini büyük bir veritabanındaki BLAST dizileriyle karşılaştırmak ve ardından veritabanında bulunan en iyi eşleşmeleri veya "isabetleri" bildirmektir. Bu basit programın iki ana uygulaması vardır.
NCBI bir veritabanı mı?
NCBI, biyoteknoloji ve biyotıp ile ilgili bir dizi veri tabanına ev sahipliği yapar ve biyoinformatik araçları ve hizmetleri için önemli bir kaynaktır. Başlıca veri tabanları, DNA dizileri için GenBank ve biyomedikal literatür için bibliyografik bir veri tabanı olan PubMed'i içerir. Diğer veritabanları arasında NCBI Epigenomics veri tabanı bulunur.
BLAST yalnızca NCBI veritabanlarında mı kullanılıyor?
BLAST, web'de NCBI web sitesinde mevcuttur. Sorgu dizilerine ve hedef veritabanlarına göre farklı BLAST türleri mevcuttur.
BLAST veritabanı nasıl çalışır?
BLAST nasıl çalışır? BLAST, başlangıçta iki dizi arasında kısa eşleşmeler bulan bir buluşsal yöntem kullanarak homolog dizileri tanımlar; bu nedenle, yöntem tüm dizi uzayını hesaba katmaz. İlk eşleşmeden sonra, BLAST bu ilk eşleşmelerden yerel hizalamalar başlatmaya çalışır.
